Windows: Отключенные элементы автозапуска в реестре

Если для включения/отключения элементов автозапуска воспользоваться msconfig или CCleaner, то в окне Сервис -> Автозагрузка -> Windows можно увидеть как готовые к автозапуску элементы, так и отключенные:
CCleaner-autostart

Однако информацию о состоянии элемента (включен/отключен) сама программа не хранит, все это хранится в реестре.

На примере DAEMON Tools Lite:

Когда элемент автозапуска отключен, информация о нем хранится в реестре в ветке
HKLM\SOFTWARE\Microsoft\Shared Tools\MSConfig\startupreg\DAEMON Tools Lite

DAY, MONTH, YEAR — день, месяц и год отключения элемента автозапуска (в шестнадцатиричном формате)
HOUR, MINUTE, SECOND — час, минута и секунда когда был отключен этот элемент
command — команда автозапуска
hkey + key — из какой ветки реестра был отключен элемент (пользователя или машины)
item — название элемента

Windows: Отключенные элементы автозапуска в реестре

Если элемент включить, вся необходимая информация (item и command) перенесется в ветку реестра hkey + key

Другой вариант:

HKLM\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\StartupApproved\Run32