Не смог найти в настройках программы запуск поиска руткитов, зато нашел, как запустить проверку из командной строки:
"C:\Program Files (x86)\Kaspersky Lab\Kaspersky Internet Security 17.0.0\avp.exe" start scan_qscan
Для других версий KIS нужно немного изменить путь.
DenTNT недавно публиковал (посмотреть все)